要彻底删除iPhone Safari的历史记录，包括清理网站数据和防止云同步，可以按照以下步骤操作：
1. 关闭Safari浏览器。
2. 在主屏幕上找到“设置”应用，并点击进入。
3. 在设置菜单中，向下滚动并找到“Safari”。
4. 点击“Safari”，然后选择“高级”。
5. 在“高级”设置中，找到“清除历史记录与网站数据”选项。
6. 点击“清除历史记录与网站数据”按钮，这将删除所有浏览过的网页和缓存数据。
7. 为了确保没有数据被云同步，请关闭Safari的云同步功能。在“设置”>“Safari”>“同步”中，取消选中“自动填充”、“密码”和“网站数据”等选项。
8. 最后，重新启动Safari浏览器，以确认已成功删除历史记录和网站数据。